| Наименование РИД |
Влияние наличие GYM-подобного мотива в составе shRNA на ее процессинг в клетках линии рака предстательной железы человека PC-3
|
| Реферат |
База данных содержит данные об изменении экспрессии микроРНК в клетках линии рака предстательной железы PC-3, трансдуцированных лентивирусными частицами, кодирующими shRNA для сверхэкспрессии микроРНК miR-93-5p. ShRNA содержат GYM-подобный мотив с целью оценить его влияние на процессинг шпильки РНКазой Dicer. После трансдукции клетки подверглись селекции в среде, содержащей гигромицин (150 мкг/мл). Культивирование клеток проводили в среде ДМЕМ с 4.5 г/л глюкозы, 4 мМ L-глутамина, 1% пенициллин-стрептомицина при 37°C и 5% CO2. В качестве контроля использовалась shRNA для нокдауна гена люциферазы светлячка LUC. Данные об экспрессии микроРНК получены методом секвенирования нового поколения на платформе Illumina NextSeq550 с длиной ридов 50 нуклеотидов. Анализ изменения экспрессии микроРНК производили с помощью DESeq2. База данных создана в рамках проекта «Микрофлюидные модели», ФИ-2025-67
|
| Возможные направления использования |
Данный РИД можно использовать при планировании последовательностей shRNA для нокдауна экспрессии какого-либо гена с целью повышения эффективность подавления экспрессии гена, или для сверхэкспрессии микроРНК с заданной последовательностью
|
| Количество опытных образцов |
0
|
| Количество просмотров |
25
|
| Наличие дополнительных файлов |
False
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[{"last_status": {"created_date": "2025-11-25T18:57:11.681284+00:00", "registration_number": "825112500138-4", "status": {"name": "Подтверждена"}}, "copyright_protections": [{"protection_way": {"name": "Осуществлена государственная регистрация"}}]}]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2025-10-13T10:50:09.302410+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
База данных
|
| Ожидаемая роль |
Исполнитель
|
| Заказчик |
Правительство Российской Федерации
|
| Руководитель работы |
Мальцева Диана Васильевна
|
| Руководитель организации |
Соколов Игорь Владимирович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
125022803038-0
|
| Последний статус |
Подтверждена, 625110100049-5, 2025-11-01 07:59:11 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области биотехнологии в области здоровья
|
| Ключевые слова |
микроРНК; shRNA; РНК интерференция; процессинга микроРНК; посттранскрипционная регуляция экспрессии генов
|
| Исполнители |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ "ВЫСШАЯ ШКОЛА ЭКОНОМИКИ"
|
| Авторы |
Жиянов Антон Павлович; Аверинская Дарья Алексеевна; Суворов Роман Владимирович; Мальцева Диана Васильевна
|
| Коды тематических рубрик |
34.15.51 - Молекулярная онкология
|
| OESR |
Биохимия и молекулярная биология
|
| Приоритеты научно-технического развития |
в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
|
