| Наименование РИД |
Программа для реализации алгоритма обработки результатов секвенирования в CRISPResso2 для оценки эффективности праймированного редактирования
|
| Реферат |
Программа предназначена для автоматизированной обработки результатов глубокого таргетного секвенирования, выполненного на образцах после проведения праймированного редактирования. Она обеспечивает приведение исходных файлов к единому формату, сопоставление экспериментальных образцов с соответствующими pegRNA, автоматический запуск анализа с использованием программы CRISPResso2 [Clement, K., Rees, H., Canver, M.C. et al. CRISPResso2 provides accurate and rapid genome editing sequence analysis. Nat Biotechnol 37, 224–226 (2019). https://doi.org/10.1038/s41587-019-0032-3], извлечение и обработку отчётных файлов, а также вычисление ключевых показателей эффективности редактирования, включая процент коррекции мутаций, распределение идеальных и неидеальных событий, частоту нежелательных изменений и общее количество прочтений. Итогом работы программы является формирование сводной таблицы с результатами и её сохранение для последующего анализа.
|
| Возможные направления использования |
Автоматизированная обработка результатов глубокого таргетного секвенирования, выполненного на образцах после проведения праймированного редактирования.
|
| Количество опытных образцов |
580
|
| Количество просмотров |
6
|
| Наличие дополнительных файлов |
False
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2025-11-10T07:40:20.649399+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
Программа для ЭВМ
|
| Ожидаемая роль |
Заказчик и Исполнитель совместно
|
| Заказчик |
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
|
| Руководитель работы |
Смирнихина Светлана Анатольевна
|
| Руководитель организации |
Куцев Сергей Иванович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
122032300392-3
|
| Последний статус |
Подтверждена, 625112800155-0, 2025-11-28 07:25:05 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области медицинских наук
|
| Ключевые слова |
глубокое таргетное секвенирование; праймированное редактирование; алгоритм обработки результатов
|
| Исполнители |
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
|
| Авторы |
Смирнихина Светлана Анатольевна; Кочергин-Никитский Константин Сергеевич; Володина Ольга Владимировна
|
| Коды тематических рубрик |
76.03.39 - Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
|
| OESR |
Генетика и наследственность (медицинская генетика относится к разделу 3)
|
| Приоритеты научно-технического развития |
в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
|
