| Наименование РИД |
Способ обогащения полноразмерных геномов норовируса на примере штаммов GII.4[P16], GII.7[P7] для проведения секвенирования методом NGS
|
| Реферат |
Изобретение относится к области биотехнологии, молекулярной биологии и вирусологии. Изобретение позволяет амплифицировать нуклеотидные последовательности полноразмерных геномов на примере наиболее распространенных норовирусных штаммов GII.4[P16], GII.7[P7] в образцах биологического материала от пациентов. Предназначено для концентрирования нуклеиновых кислот норовирусов в образцах нативного фекального материала c использованием специфической панели олигонуклеотидов для дальнейшего проведения секвенирования методом NGS.
В ходе одноэтапной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией происходит синтез комплементарной ДНК на матрице РНК и накопление продукта амплификации с применением не охарактеризованной ранее панели олигонуклеотидов.
Заявляется способ обогащения генетического материала норовирусов GII.4[P16] и GII.7[P7] методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией для дальнейшего секвенирования полученных ампликонов методом NGS. Представленный способ концентрирования норовирусных нуклеиновых кислот заключается в выделении суммарной РНК из образцов нативного фекального материала объемом 200 мкл с использованием метода фенол-хлороформной экстракции. Полученные образцы нуклеиновых кислот подвергают ОТ-ПЦР с использованием набора биолабмикс-премиум от производителя ООО «Биолабмикс» (Россия), применяя панель специфических олигонуклеотидов. Для постановки реакции к полученной смеси добавляют 5 мкл исследуемой РНК-матрицы. Температурный профиль ОТ-ПЦР: обратная транскрипция при 45⁰C в течение 60 минут, предварительная денатурация при 93⁰C в течение 3 минут, далее 44 цикла реакции, включающая денатурацию при 93⁰C в течение 10 секунд, отжиг при 56⁰C в течение 30 секунд, элонгацию при 68⁰C в течение 4 минут, финальную элонгацию при 68⁰C в течение 7 минут. Конечный объем реакционной смеси, включая РНК-матрицу, составляет 25 мкл. Далее следует очистка продуктов амплификации на магнитных частицах компании с использованием набора с использованием набора VAHTS DNA Clean Beads (Vazyme, Китай).
Технический результат заявляемого изобретения: способ позволяет концентрировать одноцепочечную норовирусную РНК путем амплификации нуклеотидных фрагментов заданной длины (800 п.о. для штамма GII.4[P16], 1000 п.о. для штамма GII.7[P7]) полноразмерного генома методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией. 1 п.ф., 2 илл.
|
| Возможные направления использования |
Изобретение относится к области биотехнологии, молекулярной биологии и вирусологии. Изобретение позволяет амплифицировать нуклеотидные последовательности полноразмерных геномов на примере наиболее распространенных норовирусных штаммов GII.4[P16], GII.7[P7] в образцах биологического материала от пациентов. Предназначено для концентрирования нуклеиновых кислот норовирусов в образцах нативного фекального материала c использованием специфической панели олигонуклеотидов для дальнейшего проведения секвенирования методом NGS.
|
| Количество опытных образцов |
1
|
| Количество просмотров |
20
|
| Наличие дополнительных файлов |
True
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2026-01-19T08:33:08.096586+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
Изобретение
|
| Ожидаемая роль |
Исполнитель
|
| Заказчик |
ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
|
| Руководитель работы |
Семенов Александр Владимирович
|
| Руководитель организации |
Семенов Александр Владимирович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
123051100045-0
|
| Последний статус |
Подтверждена, 626011900137-0, 2026-01-19 11:50:13 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области прочих естественных наук, прочие, не включенные в другие группировки
|
| Ключевые слова |
нуклеиновые кислоты; ПЦР метод; норовирус
|
| Исполнители |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ "ВИРОМ" ФЕДЕРАЛЬНОЙ СЛУЖБЫ ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
|
| Авторы |
Семенов Александр Владимирович; Итани Тарек Мохамедович; Быков Роман Олегович
|
| Коды тематических рубрик |
76.03.41 - Медицинская вирусология
|
| OESR |
Вирусология
|
| Приоритеты научно-технического развития |
Отсутствует
|
