Ядерные конденсаты с нкДНК и управление их динамикой с помощью терапевтических агентов
| Название НИОКТР | Ядерные конденсаты с нкДНК и управление их динамикой с помощью терапевтических агентов |
|---|---|
| Аннотация | Проект направлен на установление особенностей ядерных макромолекулярных конденсатов, которые способствуют онкотрансформации или развитию протеинопатий. Первым ключевым объектом исследования выступают конденсаты на суперэнхансерах (SE) – активаторы экспрессии (прото)онкогенов. Вторым объектом являются ядерные спеклы – депо регуляторов альтернативного сплайсинга (АС). В норме спеклы обрамляют конденсаты на SE ввиду сопряжения транскрипции и сплайсинга. Конечная цель проекта – подбор применимых в терапии ингибиторов сборки онкоспецифичных конденсатов на SE с параллельной оценкой побочного действия на сопряженные с ними спеклы. Потенциальные побочные эффекты за счет дерегуляции АС включают аккумуляцию патогенных белковых изоформ – индукторов онкогенеза или нейродегенеративных заболеваний, относящихся к протеинопатиям. Примером ингибиторов сборки конденсатов на SE служат малые молекулы класса BETi. Их ограничения, проявившиеся в клинических испытаниях, связаны отчасти с неполнотой изначальных представлений о конденсатах. В Проекте 2022 нами были выявлены нечувствительные к BETi конденсаты на SE, сборка которых обеспечивается неклассическими вторичными структурами ДНК (нкДНК) – гуаниновыми квадруплексами (G4). Скопления таких структур типичны для SE и промоторов онкогенов, а также генов-регуляторов нейрогенеза. Помимо активации транскрипции G4 определяют динамику ближайших к ним спеклов, а именно рекрутируют некоторые типы рибонуклеопротеинов из спеклов на траскрибируемую ДНК и хроматин-ассоциированную РНК, изменяя локальное соотношение активаторов и ингибиторов АС-событий (например, включения слабых экзонов). В Проекте 2025 предстоит выяснить, как это сказывается на соотношении зрелых мРНК, кодирующих изоформы белков-маркеров онкогенеза и протеинопатий. Также планируется оценить, как на спеклы и АС влияют отобранные на этапах Проекта 2022 низкомолекулярные ингибиторы сборки G4-зависимых конденсатов на SE (G4- лиганды), которые в теории пригодны для комбинирования с BETi в рамках противоопухолевой терапии. |
| Доступ к ОКОГУ исполнителя | False |
| Количество связанных РИД | 0 |
| Количество завершенных ИКРБС | 0 |
| Сумма бюджета | 14000.0 |
| Дата начала | 2025-06-10 |
| Дата окончания | 2026-12-31 |
| Номер контракта | 22-15-00129-П |
| Дата контракта | 2025-06-10 |
| Количество отчетов | 2 |
| УДК | 61:577.1 |
| Количество просмотров | 12 |
| Руководитель работы | Варижук Анна Михайловна |
| Руководитель организации | Лагарькова Мария Андреевна |
| Исполнитель | ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНО-КЛИНИЧЕСКИЙ ЦЕНТР ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ МЕДИЦИНЫ ИМЕНИ АКАДЕМИКА Ю.М. ЛОПУХИНА ФЕДЕРАЛЬНОГО МЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКОГО АГЕНТСТВА" |
| Заказчик | Российский научный фонд |
| Федеральная программа | — |
| Госпрограмма | — |
| Основание НИОКТР | Грант |
| Последний статус | 2025-06-24 12:32:46 UTC, 2025-06-24 12:32:46 UTC |
| ОКПД | Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области медицинских наук |
| Отраслевой сегмент | — |
| Минздрав | — |
| Межгосударственная целевая программа | — |
| Ключевые слова | ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ АГЕНТЫ; ВНУТРИКЛЕТОЧНЫЕ КОНДЕНСАТЫ; РЕГУЛЯЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ; ДНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ; G-КВАДРУПЛЕКСЫ |
| Соисполнители | — |
| Типы НИОКТР | Фундаментальное исследование |
| Приоритетные направления | — |
| Критические технологии | — |
| Рубрикатор | 76.03.31 - Медицинская биохимия |
| OECD | — |
| OESR | Медицинская химия |
| Приоритеты научно-технического развития | в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий; |
| Регистрационные номера | — |