Микробная темная материя: идентификация и характеристика новых некультивируемых линий бактерий и архей
| Название НИОКТР | Микробная темная материя: идентификация и характеристика новых некультивируемых линий бактерий и архей |
|---|---|
| Аннотация | Микроорганизмы представляют собой наиболее разнообразную и многочисленную форму жизни, в значительной мере определяющую основные биогеохимические процессы на Земле. Тем не менее, наши знания о них ограничены, поскольку обычно не более 1% микроорганизмов из природных экосистем удается культивировать в лабораторных условиях. О существовании остальных 99% «некультивируемых» стало известно лишь с появлением молекулярных методов анализа. Такие «новые» микроорганизмы обнаруживают не только в известных группах, они образуют и отдельные филогенетические линии высокого уровня. Так, благодаря применению молекулярных методов за последние 30 лет число известных таксонов высшего уровня (филумов) бактерий и архей увеличилось на порядок. В настоящее время известно уже около 200 филумов, более двух третей которых не имеет культивируемых представителей. Общее же число филумов прокариот оценивается примерно в тысячу. Чтобы подчеркнуть масштабы и значение некультивируемых микроорганизмов, для них был предложен термин «микробная темная материя». Целью проекта является идентификация и характеристика таких некультивируемых линий микроорганизмов. Основным инструментом их изучения является метагеномика, анализ «коллективного» генома микробного сообщества и выделение из него методами биоинформатики геномов отдельных организмов. Этот подход позволяет на геномном уровне описать «некультивируемые» линии микроорганизмов и предсказать их функциональную роль в экосистеме. Будут решаться две основные задачи. Первая - характеристика геномов новых линий «некультивируемых» микроорганизмов, в том числе архей филума Hadarchaeota, класса Е2 филума Thermoplasmatota, бактерий филумов Edwardsbacteria, Goldbacteria, Lithacetigenota, Marinisomatota, Poribacteria, SLNR01, BMS3Abin14 и KSB1. Вторая задача - метагеномный анализ микробных сообществ флюидов грязевых вулканов для характеристики новых «некультивируемых» линий. В ходе выполнения проекта планируется проанализировать составы микробных сообществ с помощью профилирования по генам 16S рРНК, а для образцов, содержащих значительную долю новых некультивируемых линий прокариот, провести секвенирование метагеномов и собрать MAG микроорганизмов – членов сообществ. В результате анализа MAG будет определено положение этих линий в геномной таксономической системе, проведена реконструкция путей метаболизма, анализ функциональной роли микроорганизмов в сообществе. |
| Доступ к ОКОГУ исполнителя | False |
| Количество связанных РИД | 0 |
| Количество завершенных ИКРБС | 0 |
| Сумма бюджета | 14000.0 |
| Дата начала | 2025-06-10 |
| Дата окончания | 2026-12-31 |
| Номер контракта | 22-14-00178-П |
| Дата контракта | 2025-06-10 |
| Количество отчетов | 1 |
| УДК | 579.25 |
| Количество просмотров | 11 |
| Руководитель работы | Равин Николай Викторович |
| Руководитель организации | Федоров Алексей Николаевич |
| Исполнитель | ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ БИОТЕХНОЛОГИИ" РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК" |
| Заказчик | Российский научный фонд |
| Федеральная программа | — |
| Госпрограмма | — |
| Основание НИОКТР | Грант |
| Последний статус | 2025-06-26 07:36:30 UTC, 2025-06-26 07:36:30 UTC |
| ОКПД | Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области биологических наук |
| Отраслевой сегмент | — |
| Минздрав | — |
| Межгосударственная целевая программа | — |
| Ключевые слова | ГЕНОМ; НЕКУЛЬТИВИРУЕМЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ; МЕТАГЕНОМИКА; ЭКОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ; МИКРОБНОЕ СООБЩЕСТВО |
| Соисполнители | — |
| Типы НИОКТР | Фундаментальное исследование |
| Приоритетные направления | — |
| Критические технологии | — |
| Рубрикатор | 34.27.23 - Экология микроорганизмов; 34.15.23 - Молекулярная генетика; 34.27.21 - Генетика и селекция микроорганизмов |
| OECD | — |
| OESR | Микробиология |
| Приоритеты научно-технического развития | г) переход к высокопродуктивному и экологически чистому агро- и аквахозяйству, разработку и внедрение систем рационального применения средств химической и биологической защиты сельскохозяйственных растений и животных, хранение и эффективную переработку сельскохозяйственной продукции, создание безопасных и качественных, в том числе функциональных, продуктов питания; |
| Регистрационные номера | — |