| Аннотация |
Иммунотерапия на сегодняшний день является одним из важнейших компонентов в лечении злокачественных новообразований. Наибольшие успехи были достигнуты в терапии меланомы: медиана выживаемости пациентов с метастатической формой заболевания увеличилась с 6 месяцев до 6 лет при использовании новых препаратов – ингибиторов контрольных точек (ИКТ) иммунного ответа. В то же время, при других типах рака использование ИКТ для лечения неселектированных пациентов не является обоснованным ввиду низкой вероятности ответа на терапию. Так, при колоректальном раке и при раке желудка, иммунотерапия в монорежиме демонстрирует положительный эффект лишь в отдельных группах пациентов, опухоли которых отличаются высокой мутационной нагрузкой и/или наличием дефектов в системе репарации неспаренных оснований ДНК. В то же время, ИКТ в сочетании с химиотерапией может способствовать увеличению продолжительности жизни у части пациентов с разными типами опухолей, в том числе теми, которые обычно нечувствительны к монотерапии ИКТ. Необходимость отбора пациентов на лечение ИКТ связана как с высокой стоимостью лечения, так и с вероятностью возникновения побочных эффектов, иногда тяжёлых или даже приводящих к смерти больного. Большое количество факторов, которые связаны с различиями в иммуногенности опухолей, мотивирует поиски новых маркеров, непосредственно отражающие активацию противоопухолевого иммунитета. Состав опухолевого микроокружения, в частности, инфильтрация опухоли различными субпопуляциями иммунных клеток, а также экспрессия ими и самими клетками опухоли молекул, участвующих в модуляции иммунного ответа, изучаются многими научными коллективами по всему миру. Поиск новых, более универсальных маркеров, ассоциированных с ответом на иммунотерапию, является актуальной научной проблемой, решению которой посвящён данный проект. Задачей, связанной с этой проблемой, является разработка эффективных и доступных для широкого применения методов анализа иммуногенности опухолей и их чувствительности к иммунотерапии. Мы рассчитываем, что в результате реализации данного проекта будут получены новые данные об экспрессионных маркерах/сигнатурах, имеющих значение для определения иммуногенности опухолей и их чувствительности к иммунотерапии. Для исследования таких маркеров будут использованы методы таргетного секвенирования РНК и профайлинг экспрессий 3’ концов мРНК. При помощи выбранных методов будут изучены выборки образцов опухолей желудка, колоректальных карцином, холангиокарцином, рака поджелудочной железы, а также меланом и рака лёгкого, в том числе от пациентов, чувствительных и резистентных к иммунотерапии. В результате реализации проекта будет разработана NGS-панель для анализа экспрессий выбранных генов, которая в дальнейшем может быть адаптирована для использования в клинической практике с целью персонификации лечения онкологических пациентов. Также в работе будет установлено влияние параметра NLR (соотношение нейтрофилов и лимфоцитов крови) на эффективность терапии с использованием ИКТ при меланоме и раке лёгкого.
В результате реализации проекта мы рассчитываем получить следующие результаты:
1. Будет разработана NGS-панель для анализа экспрессии генов, которые могут служить маркерами иммуногенности опухолей и их чувствительности к иммунотерапии. Для решения этой задачи мы планируем использовать ранее разработанный подход к подготовке NGS-библиотек для таргетного секвенирования РНК, основанный на использовании технологии «быстрой амплификации 3’ концов РНК» (3’ Rapid Amplification of cDNA ends или 3’ RACE) и последующей «якорной» (anchored) ПЦР [1]. Данный подход отличает простота, скорость и относительно невысокая стоимость подготовки NGS-библиотек и секвенирования. В дальнейшем разработанная панель может быть адаптирована для использования в клинической диагностике с целью персонификации терапии онкологических пациентов.
2. Будут определены маркеры/сигнатуры в составе данной NGS-панели, которые позволят выявлять опухоли желудка и колоректальные опухоли, отличающиеся высокой иммуногенностью. В настоящее время иммунотерапия в качестве первой линии назначается лишь пациентам с микросателлитной нестабильностью, в то время как высокая иммуногенность опухолей может возникать и по многим другим причинам.
3. Будет разработана новая, более эффективная модификация метода профайлинга экспрессий генов путём секвенирования 3’ концов мРНК. Данный метод предполагается использовать для реализации целей данного проекта, но в дальнейшем он может быть полезен и в других исследованиях, посвящённых, например, определению молекулярных подтипов опухолей.
4. Будут определены маркеры и экспрессионные сигнатуры, связанные с эффективностью лечения меланом и опухолей лёгкого ингибиторами контрольных точек (ИКТ) иммунного ответа. Будет изучено влияние на результат лечения соотношения нейтрофилов и лимфоцитов крови (NLR). В настоящее время отсутствуют эффективные предикторы ответа на терапию ИКТ при меланомах. Решение о назначении иммунотерапии при немелкоклеточном раке лёгкого осуществляется на основании единственного маркера – экспрессии белка PD-L1 клетками опухоли, что также не является оптимальным решением. Использование новых, более точных предикторов ответа на иммунотерапию, позволит более обоснованно назначать иммунотерапию в монорежиме или в комбинации с иммунотерапией, что повысит эффективность лечения пациентов с меланомой и раком лёгкого.
Литература:
1. Mitiushkina NV, Tiurin VI, Anuskina AA, Bordovskaya NA, Shestakova AD, Martianov AS, Bubnov MG, Shishkina AS, Semina MV, Romanko AA, Kuligina ES, Imyanitov EN. Molecular Analysis of Biliary Tract Cancers with the Custom 3' RACE-Based NGS Panel. Diagnostics (Basel). 2023 Oct 10;13(20):3168. doi: 10.3390/diagnostics13203168.
|
